• Đối tượng tham dự: Gồm 17 đội

An Biên TOTO (Thành phố Hồ Chí Minh), Đắk Lắk, Bến Tre, Đồng Nai, Hoàng Anh Gia Lai, Khatoco Khánh Hòa, Kon Tum, Long An, Quang Huy Nha Trang (sở VH, TT & DL Khánh Hòa), Tam Đảo Vĩnh Phúc (sở VH, TT & DL Vĩnh Phúc), Tây Ninh, TDC Bình Dương, TĐCS Đồng Tháp, Sóc Trăng, Vĩnh Long, Viettel, Yên Bái.

• Chia bảng Vòng loại:

Mười bảy (17) đội bóng được chia làm bốn bảng theo khu vực địa lý, cụ thể như sau:

• • Bảng A: Do CLB Tam Đảo Vĩnh Phúc đăng cai, gồm 3 đội cụ thể như sau: Tam Đảo Vĩnh Phúc, Viettel, Yên Bái
  • Bảng B: Do CLB Hoàng Anh Gia Lai đăng cai, gồm 4 đội cụ thể: Hoàng Anh Gia Lai, Đắk Lắk, Khatoco Khánh Hòa, Kon Tum.
  • Bảng C: Do CLB An Biên TOTO (TPHCM) đăng cai, gồm 5 đội cụ thể như sau: An Biên TOTO, Đồng Nai, Quang Huy Nha Trang (Sở VH, TT & DL Khánh Hòa),Tây Ninh, TDC Bình Dương.
  • Bảng D: Do Sở VHTT&DL Vĩnh Long đăng cai, gồm 5 đội cụ thể: Vĩnh Long, Bến Tre, Long An, TĐCS Đồng Tháp, Sóc Trăng.
• Lên hạng:

Các đội tham ra thi đấu vòng tròn một lượt tính điểm, xếp hạng ở mỗi bảng để chọn bốn đội xếp thứ nhất vào thi đấu ở Vòng chung kết. Hai đội thắng được xếp đồng hạng nhất giải bóng đá Hạng Ba Toàn Quốc năm 2012 và sẽ được thi đấu ở giải bóng đá Hạng Nhì Quốc gia năm 2013.